Le lieu est resté vide pendant un bon moment, mais les nombreux concours d'architecture et les discussions n’ont pris une forme concrète qu'après une suggestion d'Andrzej Wajda en 1998. Lors du festival Cracovie 2000, le metteur en scène a proposé de construire un pavillon appelé « Wyspiański 2000 », qui porte aujourd'hui le nom de Pavillon Wyspiański. Le projet prévoyait d'incorporer dans la façade du bâtiment trois vitraux non encore réalisés de Stanisław Wyspiański. La construction a commencé en 2005 et le bâtiment, conçu par Krzysztof Ingarden, a été inauguré en 2007. Sur la façade du pavillon sont exposés trois vitraux conçus par Stanisław Wyspiański et réalisés par Piotr Ostrowski. Ces vitraux représentent Saint Stanislas, Casimir le Grand et Henri le Pieux. Le bâtiment en lui-même a une forme architecturale assez intéressante : sa façade est composée de dalles mobiles en brique montées sur des tiges métalliques. Le réglage du positionnement de ces dalles permet d’éclairer l'intérieur de façon adéquate. Aujourd'hui le pavillon est un lieu de conférences, de rencontres littéraires et d'autres événements culturels géré par le Bureau des festivals de Cracovie. Il abrite également le point d'information touristique de la ville.